Thank you for sending your enquiry! One of our team members will contact you shortly.
Thank you for sending your booking! One of our team members will contact you shortly.
Kursplan
I. Innledning og forarbeid
1. Oversikt
- Gjøre R mer vennlige, R og tilgjengelige GUI-er Rstudio Relatert programvare og dokumentasjon R og statistikk Bruke R interaktivt En introduksjonsøkt Få hjelp med funksjoner og funksjoner R-kommandoer, sensitivitet for store og små bokstaver osv. Gjenkalling og korrigering av tidligere kommandoer Utføre kommandoer fra eller viderekoble utdata til en fil Datapermanens og fjerning av objekter Goav programmeringspraksis: Selvstendige skript, god lesbarhet, f.eks. strukturerte skript, dokumentasjon, installeringspakker for markdown; CRAN og Bioconductor
2. Lese data
- Txt-filer (read.delim) CSV-filer
3. Enkle manipulasjoner; tall og vektorer + matriser
- Vektorer og tilordning Vektoraritmetikk Generere regulære sekvenser Logiske vektorer Manglende verdier Tegnvektorer Indeksvektorer; velge og endre undersett av et datasett Arrays
Lister Konstruere og endre lister Sammenslå lister
- Datarammer Lage datarammer
6. Mer om lesing av data
- XLS, XLSX filer readr og readxl pakker SPSS, SAS, Stata,... og andre formater data Eksportere data til txt, csv og andre formater
6. Gruppering, looper og betinget utførelse
- Grupperte uttrykk Kontrollsetninger Betinget utførelse: if-setninger Gjentatt utførelse: for løkker, gjenta og mens introduksjon til gjelder, lapply, sapply, trykk
7. Funksjoner
- Opprette funksjoner Valgfrie argumenter og standardverdier Variabelt antall argumenter Omfang og dets konsekvenser
8. Enkel grafikk i R
- Opprette en graf Tetthetsplott Punktplott Søylediagram Linjediagram Sektordiagram Boksplott Spredningsplott Kombinere plott
II. Statistisk analyse i R
- 1. Sannsynlighetsfordelinger
R som et sett med statistiske tabeller Undersøker fordelingen av et sett med data
2. Testing av hypoteser
- Tester om en populasjonsgjennomsnittlig sannsynlighetsratiotest En- og to-utvalgstester Chi-Square Gogodness-of-Fit-test Kolmogorov-Smirnov Én-prøvestatistikk Wilcoxon Signed-Rank Test To-Sample Test Wilcoxon Rank Sum Test Mann-Whitney Test Kolmogorov-Smirnov Test
3. Multippel testing av hypoteser
- Type I-feil- og FDR ROC-kurver og AUC Multiple Testing-prosedyrer (BH, Bonferroni etc.)
4. Lineære regresjonsmodeller
- Generiske funksjoner for å trekke ut modellinformasjon Oppdatering av tilpassede modeller Generaliserte lineære modeller Familier Glm()-funksjonen
Klassifikasjon Logistisk regresjon
- Lineær diskrimineringsanalyse
III. Arbeidet problemstillinger innen bioinformatikk
- Kort introduksjon til limma-pakken Microarray dataanalyse arbeidsflyt Datanedlasting fra GEO: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE1397 Databehandling (QC, normalisering, differensialuttrykk) Vulkanplott Custering eksempler + varmekart
28 timer
Testimonials (5)
how the trainor shows his knowledge in the subject he's teachign
john ernesto ii fernandez - Philippine AXA Life Insurance Corporation
Kurs - Data Vault: Building a Scalable Data Warehouse
Open discussion with trainer
Tomek Danowski - GE Medical Systems Polska Sp. Z O.O.
Kurs - Process Mining
The pace was just right and the relaxed atmosphere made candidates feel at ease to ask questions.
Rhian Hughes - Public Health Wales NHS Trust
Kurs - Introduction to Data Visualization with Tidyverse and R
Richard's training style kept it interesting, the real world examples used helped to drive the concepts home.
Jamie Martin-Royle - NBrown Group
Kurs - From Data to Decision with Big Data and Predictive Analytics
The example and training material were sufficient and made it easy to understand what you are doing.