Gode kliniske praksis (GCP) Treningskurs

Dette er en praktisk verksted som introduserer grunnleggende bioinformatikk. Det er rettet mot personer med grunnleggende biologisk bakgrunn og kunnskap innen molekylærbiologi, som ønsker å lære hvordan de skal behandle og arbeide med biologisk data ved hjelp av dataverktøy. Det er spesielt designet for:

• Forskere som arbeider i eksperimentelle laboratorier med biologiske makromolekyler som proteiner, RNA og DNA.
• Forskere hvis hovedområde ikke er biologi, men de må håndtere biologisk data.
• Ledere som introduserer nye produkter (f.eks. medisiner), som ønsker å utvide sin kunnskap om dagens bioinformatikk.
• Programmerere som skal skrive programmer som håndterer biologiske molekyler.

Kurset er delt inn i to deler: teoretisk og praktisk. Forelesningen er sammenflettet med enkle praktiske øvelser, quizzer og tester for å sikre at deltakerne forstår konseptene.

Under opplæringen vil vi ta deg med på en guidet tur som dekker alle grunnleggende aspekter ved analyse av biologisk data. Dette verkstedet er en ideell mulighet til å bli kjent med bioinformatikk og dens mange sider! Ved slutten bør du kunne håndtere ethvert grunnleggende bioinformatikkproblem: du vil vite hvor du får de nødvendige dataene fra, hvordan du får relevante informasjon og hvordan grunnleggende programvare og algoritmer fungerer. Vårt mål er å lette din forståelse av biologisk data.

Ved kursets slutt vil du kunne arbeide med biologisk data ved hjelp av bioinformatikkverktøy.

Denne instruktørledede, liveopplæringen i Norge (online eller på stedet) er rettet mot helsepersonell og arbeidere som ønsker å lære kunnskap på middels til avansert nivå om de forskjellige genetiske sekvenserings- og testoperasjonene.

Ved slutten av denne opplæringen vil deltakerne kunne:

• Lær og forstå nøkkelbegreper innen genetikk.
• Forstå hvordan genetisk sekvensering og testing fungerer.

Mikrobielle genomikk og metagenomikk kombinerer sekvenseringsteknologier og databehandling for å profilere mikrobielle samfunn, karakterisere genom og oppdage funksjonelle egenskaper som antimikrobiell resistens.

Denne instruktørlede, live-treningen (online eller på sted) er rettet mot forskere og bioinformatikere på begynnernivå til mellomnivå som ønsker å utføre hånds-på analyse av sekvenseringsdata fra mikrobiell genomikk og metagenomikk.

Ved avslutningen av denne treningen vil deltakerne kunne:

• Beskrive vanlige sekvenseringsarbeidsflyter og nøkkel-filformater som brukes i mikrobiell genomikk.
• Utføre kvalitetskontroll og forbehandling av rå NGS-lesninger.
• Utføre taksonomisk profilering ved bruk av markørbaserte og k-mer-metoder.
• Montere og annotere mikrobiell genom og plasmider.
• Oppdage SNPs, bygge filogenier og tolke populasjonsstruktur.
• Forutsi antimikrobiell resistensgen og summere funksjonelle profiler.
• Bruke gjentakbare arbeidsflyter med Conda, Docker og notatbaserte rapporter.

Format på kurset

• Forelesninger som introduserer konsepter og verktøy (20%).
• Hånds-på praktiske øvelser ved bruk av eksempeldatasett (60%).
• Åpne diskusjoner og veiledet analyse slik at deltakerne kan anvende metoder på sine egne data (20%).

Kurs tilpassingsalternativer

• For å be om en tilpasset workshop som fokuserer på klinisk, miljømessig eller industriell metagenomikk, kontakt oss for å avtale.

Denne instruktørledede, direkteopplæringen i Norge (online eller på stedet) er rettet mot forskere og alle som er interessert i å lære om det grunnleggende om nanovitenskap og dets applikasjoner.

Ved slutten av denne opplæringen vil deltakerne kunne:

• Forstå feltet nanovitenskap og nanoteknologi.
• Skille de i nano-området fra de i mikroområdet.
• Kjenne til den grunnleggende teorien om elektron- og energioverføring.

Dette er et praktisk kurs, som viser hvorfor programmering er et kraftig verktøy i sammenheng med å løse biologiske problemer. I løpet av kurset vil deltakerne bli undervist i programmeringsspråket Python, et språk som anses som både kraftig og enkelt å bruke. Dette kurset kan betraktes som en demonstrasjon av hvordan bioinformatikk forbedrer biologers liv.

Kurset er designet og rettet mot personer uten informatikkbakgrunn som ønsker å lære å programmere.

Dette kurset passer for:

• Forskere som arbeider med biologiske data.
• Forskere som ønsker å lære å automatisere hverdagsoppgaver og analysere data.
• Ledere som ønsker å lære hvordan programmering forbedrer arbeidsflyter og gjennomføring av prosjekter.

Ved slutten av kurset vil deltakerne kunne skrive korte programmer, som lar dem manipulere, analysere og håndtere biologiske data og presentere resultater i et grafisk format.

Dette kurset har som mål å gi forskere en forståelse av prinsippene for statistisk design og analyse og deres relevans for forskning innen forskjellige vitenskapelige disipliner.

Det dekker en del sannsynlighet og statistiske metoder, hovedsakelig gjennom eksempler. Denne opplæringen inneholder rundt 30 % forelesninger, 70 % veiledede quizzes og laboratorier.

I tilfelle av lukkede kurs kan vi tilpasse eksemplene og materialene til en spesifikk gren (som psykologitester, offentlig sektor, biologi, genetikk, etc.).

I tilfelle av offentlige kurs brukes blandede eksempler.

Selv om forskjellige programmer brukes under dette kurset (Microsoft Excel til SPSS, Statgraphics, etc.), ligger hovedfokuset på å forstå prinsippene og prosessene som veileder forskning, resonnering og konklusjoner.

Dette kurset kan leveres som et blandingskurs, det vil si med hjemmelekser og oppgaver.