Grundleggende prinsipper i bioinformatikk Treningskurs

Denne instruktørledede, direkteopplæringen i Norge (online eller på stedet) er rettet mot biologer som ønsker å bruke Biopython.

Ved slutten av denne opplæringen vil deltakerne kunne:

• Integrer biologiske konsepter med informasjonsteknologi for å løse forskningsproblemer.
• Mine informasjon fra store datasett av biologisk opprinnelse.
• Lag algoritmer for viktige forskningsoppgaver.

Denne instruktørledede, liveopplæringen i Norge (online eller på stedet) er rettet mot helsepersonell og arbeidere som ønsker å lære kunnskap på middels til avansert nivå om de forskjellige genetiske sekvenserings- og testoperasjonene.

Ved slutten av denne opplæringen vil deltakerne kunne:

• Lær og forstå nøkkelbegreper innen genetikk.
• Forstå hvordan genetisk sekvensering og testing fungerer.

God klinisk praksis (GCP) er et sett med retningslinjer for klinisk forskning utført på menneskelige deltakere. GCP tjener som internasjonal standard for utforming, gjennomføring, overvåking, dokumentasjon, analyse og rapportering av kliniske studier.

I denne instruktørledede, levende opplæringen vil deltakerne lære de viktigste retningslinjene og grunnleggende prinsipper som brukes i God Klinisk Praksis (GCP) for kliniske studier og forskning som involverer menneskelige deltakere. Dette kurset gir en oversikt over de forskjellige GCP-områdene, men legger litt mer vekt på ICH-sentrert GCP for forskningsmedikamenter og biologika.

Ved slutten av denne opplæringen vil deltakerne være i stand til:

• Forstå de grunnleggende prinsippene for GCP for forskningsmedikamenter og biologika basert på International Conference on Harmonization (ICH)
• Anvende retningslinjene som er fastsatt av GCP i deres kliniske forskning og studier

Målgruppe

• Kliniske forskere
• Kliniske forskningsprofesjonelle
• Helse- og medisinske profesjonelle
• Støttepersonell for kliniske studier
• Forskning- og utviklingspersonell

Kursformat

• Delen forelesninger, delen diskusjoner, øvelser og mye praktisk øving

Mikrobielle genomikk og metagenomikk kombinerer sekvenseringsteknologier og databehandling for å profilere mikrobielle samfunn, karakterisere genom og oppdage funksjonelle egenskaper som antimikrobiell resistens.

Denne instruktørlede, live-treningen (online eller på sted) er rettet mot forskere og bioinformatikere på begynnernivå til mellomnivå som ønsker å utføre hånds-på analyse av sekvenseringsdata fra mikrobiell genomikk og metagenomikk.

Ved avslutningen av denne treningen vil deltakerne kunne:

• Beskrive vanlige sekvenseringsarbeidsflyter og nøkkel-filformater som brukes i mikrobiell genomikk.
• Utføre kvalitetskontroll og forbehandling av rå NGS-lesninger.
• Utføre taksonomisk profilering ved bruk av markørbaserte og k-mer-metoder.
• Montere og annotere mikrobiell genom og plasmider.
• Oppdage SNPs, bygge filogenier og tolke populasjonsstruktur.
• Forutsi antimikrobiell resistensgen og summere funksjonelle profiler.
• Bruke gjentakbare arbeidsflyter med Conda, Docker og notatbaserte rapporter.

Format på kurset

• Forelesninger som introduserer konsepter og verktøy (20%).
• Hånds-på praktiske øvelser ved bruk av eksempeldatasett (60%).
• Åpne diskusjoner og veiledet analyse slik at deltakerne kan anvende metoder på sine egne data (20%).

Kurs tilpassingsalternativer

• For å be om en tilpasset workshop som fokuserer på klinisk, miljømessig eller industriell metagenomikk, kontakt oss for å avtale.

Denne instruktørledede, direkteopplæringen i Norge (online eller på stedet) er rettet mot forskere og alle som er interessert i å lære om det grunnleggende om nanovitenskap og dets applikasjoner.

Ved slutten av denne opplæringen vil deltakerne kunne:

• Forstå feltet nanovitenskap og nanoteknologi.
• Skille de i nano-området fra de i mikroområdet.
• Kjenne til den grunnleggende teorien om elektron- og energioverføring.

Denne instruktørledede, levende opplæring på Norge (online eller på stedet) er rettet mot avanserte forensiske vitenskapsmenn, genetikere og antropologer som ønsker å anvende NGS-teknikker i forensiske etterforskninger.

Ved slutten av denne opplæringen vil deltakerne være i stand til:

• Forstå prinsippene for NGS og dets forensiske anvendelser.
• Analysere forensiske DNA-prøver ved bruk av NGS-teknikker.
• Tolke NGS-data for menneskelig identifisering og avklaring av slektskap.
• Bruk NGS i nedbrutte og komplekse DNA-prøver.
• Bruk bioinformatikkverktøy for forensisk genomisk analyse.
• Forstå juridiske og etiske hensyn i forensisk genomikk.

Dette er et praktisk kurs, som viser hvorfor programmering er et kraftig verktøy i sammenheng med å løse biologiske problemer. I løpet av kurset vil deltakerne bli undervist i programmeringsspråket Python, et språk som anses som både kraftig og enkelt å bruke. Dette kurset kan betraktes som en demonstrasjon av hvordan bioinformatikk forbedrer biologers liv.

Kurset er designet og rettet mot personer uten informatikkbakgrunn som ønsker å lære å programmere.

Dette kurset passer for:

• Forskere som arbeider med biologiske data.
• Forskere som ønsker å lære å automatisere hverdagsoppgaver og analysere data.
• Ledere som ønsker å lære hvordan programmering forbedrer arbeidsflyter og gjennomføring av prosjekter.

Ved slutten av kurset vil deltakerne kunne skrive korte programmer, som lar dem manipulere, analysere og håndtere biologiske data og presentere resultater i et grafisk format.

Dette kurset har som mål å gi forskere en forståelse av prinsippene for statistisk design og analyse og deres relevans for forskning innen forskjellige vitenskapelige disipliner.

Det dekker en del sannsynlighet og statistiske metoder, hovedsakelig gjennom eksempler. Denne opplæringen inneholder rundt 30 % forelesninger, 70 % veiledede quizzes og laboratorier.

I tilfelle av lukkede kurs kan vi tilpasse eksemplene og materialene til en spesifikk gren (som psykologitester, offentlig sektor, biologi, genetikk, etc.).

I tilfelle av offentlige kurs brukes blandede eksempler.

Selv om forskjellige programmer brukes under dette kurset (Microsoft Excel til SPSS, Statgraphics, etc.), ligger hovedfokuset på å forstå prinsippene og prosessene som veileder forskning, resonnering og konklusjoner.

Dette kurset kan leveres som et blandingskurs, det vil si med hjemmelekser og oppgaver.