Kursplan

Introduksjon til Fiji og ImageJ

  • Oversikt over Fiji og dens anvendelser innen vitenskapelig forskning
  • Forståelse av ImageJs arkitektur og plugins
  • Installering og oppsett av Fiji for optimal ytelse

Grunnleggende bildebehandlingsteknikker

  • Innhenting av bilder og importformater
  • Justering av kontrast, lysstyrke og påføring av filtre
  • Bildestabling og prosjektjonsmetoder

Avansert Image Analysis

  • Segmenteringsteknikker: tærskelverdi og kantdeteksjon
  • Tellings av objekter og partikkelanalyse i histologiske prøver
  • Måling av områder, omkretser og andre morfologiske egenskaper

Arbeid med Biologiske prøver

  • Behandling av bilder av histologiske vev, blodceller og alger
  • Fargeavskillelse og analyse av farget vev
  • Tidskapsanalyse og sporing av cellebevegelse

Automatisering og tilpasning

  • Oppretting og kjøring av makroer for gjentatte oppgaver
  • Bruk av Fiji plugins for spesialiserte analyser
  • Grunnleggende scripting med ImageJ Macro Language (IJM)

Data Management og rapportering

  • Eksport av resultater og generering av rapporter
  • Annotering av bilder og forberedelse av data for publisering
  • Beste praksis for gjentagbar bildeanalyse

Oppsummering og neste trinn

Krav

  • Grunnleggende forståelse av konsepter innen biologisk bildedannelse
  • Kjennskap med mikroskopi og histologiske teknikker
  • Grunnleggende datakompetanse

Målgruppe

  • Forskningspersonell innen bioteknologi og miljøtoksikologi
  • Laboratorieteknikere som arbeider med histologisk og cellebildedannelse
  • Vitenskapsfolk interessert i kvantitativ bildeanalyse
 14 timer

Antall deltakere


Price per participant

Upcoming Courses

Related Categories